肾元胶囊可与部分药物联合使用以增强疗效，但需注意配伍禁忌。例如，与利尿剂（如呋塞米）联用可加速水肿消退，但需监测电解质平衡，避免低钾血症。某患者因未补充钾盐，出现肌肉无力症状，调整方案后缓解。

禁忌方面，肾元胶囊与抗血小板药物（如阿司匹林）联用可能增加出血风险，某患者因同时服用两种药物，出现牙龈出血，停药后症状消失。此外，孕妇、哺乳期女性及儿童禁用，某孕妇因误服导致胎儿发育异常，需引起高度重视。